Molecular methods in ecology and microbiology

Celem pracowni jest teoretyczno-praktyczne zapoznanie studentów z nowoczesnymi technikami badawczymi w ekologii i mikrobiologii z zastosowaniem technik biologii molekularnej

Wykłady:

- Markery genetyczne: allozymy, mikrosatelity, AFLP, SNP, sekwencje DNA

- Technika PCR

- Sekwencjonowanie DNA: klasyczne i wielkoskalowe

- Metody nieinwazyjne i niedestrukcyjne

- Identyfikacja molekularna: gatunków i mieszańców, bioróżnorodności, osobników, płci, rodzicielstwa

- Ocena zmienności genetycznej populacji czynniki kształtujące zmienność

- Molekularne metody badania przepływu genów i struktury geograficznej populacji

- Wnioskowanie o przeszłości ewolucyjnej populacji na podstawie genealogii genów i filogeografii

- Metody molekularne w genetyce konserwatorskiej

- Monitoring organizmów modyfikowanych genetycznie

- Metody badania doboru naturalnego na poziomie molekularnym

Ćwiczenia:

- Izolacja DNA

- Technika PCR

- Elektroforeza DNA

- Sekwencjonowanie DNA

- Programy do analiz genetyczno populacyjnych

- Bazy sekwencji biologicznych, porównywanie sekwencji kwasów nukleinowych i białek

Wykłady:

Przedmiotowe efekty uczenia się w zakresie wiedzy:

Efekt przedmiotowy 1: student rozumie w pogłębionym stopniu zaawansowane zjawiska i procesy biologiczne oraz kluczowe zagadnienia z zakresu zaawansowanej szczegółowej wiedzy biologicznej

Efekt przedmiotowy 2: student rozumie najważniejsze problemy z zakresu różnych działów biologii oraz zna wzajemne powiązania nauk biologicznych z innymi dyscyplinami przyrodniczymi oraz z naukami ścisłymi

Efekt przedmiotowy 3: student zna zakres aktualnych problemów biologii oraz kierunku głównych tendencji rozwojowych w dyscyplinie nauk biologicznych

Ćwiczenia:

Przedmiotowy efekt uczenia się w zakresie umiejętności:

Efekt przedmiotowy 4:- stosuje zaawansowane techniki i narzędzia badawcze biologii molekularnej

Efekt przedmiotowy 5: wykonuje zlecone zadania badawcze lub ekspertyzy pod kierunkiem opiekuna naukowego

Efekt przedmiotowy 6: stosuje techniki informatyczne i statystyczne do opisu zjawisk i analizy danych

Efekt przedmiotowy 7: wykazuje umiejętność formułowania uzasadnionych sądów na podstawie danych pochodzących z różnych źródeł

Przedmiotowe efekty uczenia się w zakresie kompetencji społecznych:

Efekt przedmiotowy 8 - potrafi współdziałać i pracować w grupie, przyjmując w niej różne role.

Przedmiotowe efekty kształcenia przypisane do wykładów (1-3).

Przedmiotowe efekty kształcenia przypisane do ćwiczeń (4-8).

Opis ECTS dla przedmiotu: 3 ECTS [1 ECTS=30h]

Udział w wykładach: 15 godzin

Przygotowanie do egzaminu: 15 godzin

Udział w laboratoriach: 15 godzin

Uzupełnianie zeszytu ćwiczeń: 15 godzin

przygotowanie do kolokwiów: 15 godzin

Udział w konsultacjach: 15 godzin

suma: 90h [90/30=4=3]

Test pisemny - weryfikacja efektów kształcenia poprzez test pisemny częściowo jednokrotnego wyboru, część testu stanowią pytania otwarte.

Ocena końcowa zależy od punktów z testu; aby uzyskać zaliczenie na 3 (dostateczny) - min. 60% wymagane jest , na 4 (dobry) - min. 75%, na 5 (bardzo dobry) - min. 90%.

Obecność na zajęciach - dwie nieobecności na zajęcia są dopuszczone w semestrze, w szczególnych przypadkach (szpital, specjalne losowe wypadki) można zaakceptować trzy nieobecności. Trzy nieobecności - obniżenie oceny o 0,5, więcej nieobecności - zajęcia niepełne, niezaliczone.

nie dotyczy