Clinical Microbiology

Celem nauczania przedmiotu Mikrobiologia kliniczna jest zapoznanie studentów z rekomendacjami, wytycznymi, procedurami w zakresie mikrobiologii klinicznej i terapii przeciwinfekcyjnej oraz prewencji i kontroli zakażeń.

Student zostanie zapoznany z podstawami instrumentalnymi i metodologicznymi wykonywania badań mikrobiologicznych, z możliwymi błędami przedanalitycznymi, pozna parametry laboratoryjne kluczowe w diagnostyce i monitorowaniu przebiegu zakażenia oraz nauczy się analizować i interpretować wyniki badań mikrobiologicznych.

Celem nauczania przedmiotu Mikrobiologia kliniczna jest zapoznanie studentów z rekomendacjami, wytycznymi, procedurami w zakresie mikrobiologii klinicznej i terapii przeciwinfekcyjnej oraz prewencji i kontroli zakażeń.

Student zostanie zapoznany z podstawami instrumentalnymi i metodologicznymi wykonywania badań laboratoryjnych, z możliwymi błędami przedanalitycznymi, pozna parametry laboratoryjne kluczowe w diagnostyce i monitorowaniu przebiegu zakażenia oraz nauczy się analizować i interpretować wyniki badań mikrobiologicznych.

Przedmiot realizowany jest w semestrze zimowym na 4. roku kształcenia na kierunku lekarskim i obejmuje 10 h seminariów i 10 h ćwiczeń praktycznych – przegląd rekomendacji, wytycznych i procedur, analiza przypadków klinicznych i wyników badań laboratoryjnych.

Szczegółowa tematyka zajęć w zakresie seminariów obejmuje następujące zagadnienia:

1. Rekomendacje diagnostyki i terapii zakażeń układu oddechowego.

2. Rekomendacje diagnostyki i terapii zakażeń o etiologii Clostridioides difficile.

3. Rekomendacje diagnostyki i terapii zakażeń skóry i tkanek miękkich.

4. Szpitalna lista antybiotyków i polityka antybiotykowa w szpitalu.

5. Leki przeciwinfekcyjne stosowane w lecznictwie otwartym (opieka ambulatoryjna) i zamkniętym (szpitale). Profilaktyka zakażeń – szczepienia ochronne, okołooperacyjna profilaktyka antybiotykowa.

6. Diagnostyka i terapia zakażeń łożyska naczyniowego i infekcyjnego zapalenia wsierdzia.

7. Diagnostyka i terapia zakażeń grzybiczych.

8. Diagnostyka serologiczna w rozpoznawaniu i monitorowaniu zakażeń.

9. Epidemiologia wybranych chorób zakaźnych, problematyka lekooporności.

10. Diagnostyka i terapia zakażeń układu moczowego.

Tematyka ćwiczeń:

1. Analiza przypadków i interpretacja wyników badań laboratoryjnych: zakażenia układu oddechowego.

2. Analiza przypadków i interpretacja wyników badań laboratoryjnych: kolonizacja i zakażanie szczepami alarmowymi.

3. Analiza przypadków i interpretacja wyników badań laboratoryjnych: zakażenia układu moczowego.

4. Analiza przypadków i interpretacja wyników badań laboratoryjnych: zakażenia skóry i tkanek miękkich.

5. Analiza przypadków i interpretacja wyników badań laboratoryjnych: zakażenia wywołane przez wirusy hepatotropowe.

6. Zakażenia szpitalne. Mapowanie mikrobiologiczne.

7. Współpraca z laboratorium medycznej diagnostyki mikrobiologicznej.

8. Zakażanie w oddziałach intensywnej opieki medycznej i intensywnej terapii.

9. Markery zakażania.

10. Kolokwium zaliczające w formie pisemnej – analiza przypadku.

Literatura obowiązkowa:

Rekomendacje diagnostyki i terapii zakażeń. http://antybiotyki.edu.pl/rekomendacje/rekomendacje-diagnostyki-i-terapii-zakazen/

Diagnostyka laboratoryjna z elementami biochemii klinicznej wyd.5 B. Solnica, A. Dembińska-Kieć, J.W. Naskalski lub wydania poprzednie.

MYKOLOGIA MEDYCZNA, red. A. Kurnatowska, P. Kurnatowski; ISBN 978-83-65835-77-2.

PREWENCJA I KONTROLA ZAKAŻEŃ, oprac. V. Thomas, wyd. I polskie, red. B. Bober-Gheek, ISBN 978-83-7609-494-6.

ATLAS CHORÓB ZAKAŹNYCH DZIECI. I. Kacprzak-Bergman, L. Szenborn; ISBN 978-83-60290-07-1

Clinical Microbiology Review, https://https://journals.asm.org/journal/cmr

W zakresie wiedzy student zna:

WMKL_C.W12 drobnoustroje, z uwzględnieniem chorobotwórczych i obecnych we florze fizjologicznej;

WMKL_C.W23 typy reakcji nadwrażliwości, rodzaje niedoborów odporności i podstawy immunomodulacji;

WMKL_C.W24 zagadnienia z zakresu immunologii nowotworów;

WMKL_C.W25 genetyczne podstawy doboru dawcy i biorcy oraz podstawy immunologii transplantacyjnej;

WMKL_C.W33 czynniki chorobotwórcze zewnętrzne i wewnętrzne, modyfikowalne i niemodyfikowalne;

*****

WMKL_C.W11 genetyczne mechanizmy nabywania lekooporności przez drobnoustroje i komórki nowotworowe;

WMKL_C.W12 drobnoustroje, z uwzględnieniem chorobotwórczych i obecnych we florze fizjologicznej;

WMKL_C.W13 epidemiologię zarażeń wirusami i bakteriami oraz zakażeń grzybami i pasożytami, z uwzględnieniem geograficznego zasięgu ich występowania;

WMKL_C.W14 wpływ abiotycznych i biotycznych (wirusy, bakterie) czynników środowiska na organizm człowieka i populację ludzi oraz drogi ich wnikania do organizmu człowieka;

WK WMKL_C.W15 konsekwencje narażenia organizmu człowieka na różne czynniki chemiczne i biologiczne oraz zasady profilaktyki;

WMKL_C.W18 objawy zakażeń jatrogennych, drogi ich rozprzestrzeniania się i patogeny wywołujące zmiany w poszczególnych narządach;

WMKL_C.W19 podstawy diagnostyki mikrobiologicznej i parazytologicznej;

WMKL_C.W40 problem lekooporności, w tym lekooporności wielolekowej;

W zakresie umiejętności student potrafi:

WMKL_C.U08 posługiwać się reakcją antygen - przeciwciało w aktualnych modyfikacjach i technikach dla diagnostyki chorób zakaźnych, alergicznych, autoimmunizacyjnych i nowotworowych oraz chorób krwi;

WMKL_C.U09 przygotowywać preparaty i rozpoznawać patogeny pod mikroskopem;

WMKL_C.U10 interpretować wyniki badań mikrobiologicznych;

WMKL_C.U11 powiązać obrazy uszkodzeń tkankowych i narządowych z objawami klinicznymi choroby, wywiadem i wynikami oznaczeń laboratoryjnych;

WMKL_C.U15 projektować schematy racjonalnej chemioterapii zakażeń, empirycznej i celowanej;

WMKL_D.U17 krytycznie analizować piśmiennictwo medyczne, w tym w języku angielskim, i wyciągać wnioski;

WMKL_E.U24 interpretować wyniki badań laboratoryjnych i identyfikować przyczyny odchyleń od normy;

WMKL_E.U28 pobierać i zabezpieczać materiał do badań wykorzystywanych w diagnostyce laboratoryjnej;

Do oceny kolokwium studentów stosowane są następujące kryteria:

- Ocena bardzo dobra (5): student zna, rozumie i wyjaśnia zakładane efekty kształcenia i potrafi je zastosować w praktyce w stopniu bardzo dobrym

- Ocena ponad dobra (4,5): student zna, rozumie i wyjaśnia zakładane efekty kształcenia i potrafi je zastosować w praktyce w stopniu ponad dobrym

- Ocena dobra (4): student zna, rozumie i wyjaśnia zakładane efekty kształcenia

i potrafi je zastosować w praktyce w stopniu dobrym

- Ocena dość dobra (3,5): student zna, rozumie i wyjaśnia zakładane efekty kształcenia i potrafi je zastosować w praktyce w stopniu dość dobrym

- Ocena dostateczna (3): student zna, rozumie i wyjaśnia zakładane efekty kształcenia i potrafi je zastosować w praktyce w stopniu dostatecznym.

Egzamin testowy oceniany jest wg następujących kryteriów:

<60% pkt – niedostateczny (2);

60-67% pkt – dostateczny (3);

68-75% pkt – dość dobry (3,5);

76-83% pkt – dobry (4,0);

84-91% pkt - ponad dobry (4,5);

92-100% pkt – bardzo dobry (5).

Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest obecność na wszystkich zajęciach oraz uzyskanie minimum oceny dostatecznej z kolokwium pisemne - analiza przypadku/ wyników badań laboratoryjnych pacjenta w oparciu o krótką epikryzę.

W ramach przedmiotu nie przewidziano egzaminu w terminie zerowym.

W przypadku nieobecności na zajęciach student musi odpowiedzieć z tematu w którym nie uczestniczył u koordynatora przedmiotu lub osoby przez niego wyznaczonej.

nie stosuje się.