Metody molekularne w ekologii i ochronie przyrody
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | WF-OB-MOL |
Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(9998) Sustainable development
|
Nazwa przedmiotu: | Metody molekularne w ekologii i ochronie przyrody |
Jednostka: | Centrum Ekologii i Ekofilozofii |
Grupy: |
Przedmioty obowiązkowe dla 1 roku studiów II stopnia magisterskich MONITORING |
Punkty ECTS i inne: |
0 LUB
3.00
(w zależności od programu)
|
Język prowadzenia: | polski |
Dyscyplina naukowa, do której odnoszą się efekty uczenia się: | nauki biologiczne |
Poziom przedmiotu: | zaawansowany |
Symbol/Symbole kierunkowe efektów uczenia się: | OB2_W02 OB2_W12 OB2_U01 OB2_U04 OB2_K02 |
Wymagania wstępne: | znajomość podstaw zoologii, ekologii, biochemii i genetyki oraz bierna znajomość języka angielskiego |
Skrócony opis: |
Przedmiot wprowadza podstawy wykorzystania metod molekularnych do zrozumienia ekologii i ewolucji dzikich gatunków oraz ich ochrony. |
Pełny opis: |
Prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. Wykład: 1. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej. 2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA 3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody 4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów) 7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji) 10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia). 15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy) Ćwiczenia: 1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni 2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru) 4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera 6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy 7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja |
Literatura: |
Wybrane rozdziały z: 1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa 2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa Literatura uzupełniająca: 1. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa 2. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 3. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 4. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
Efekty kształcenia i opis ECTS: |
a) Efekty kształcenia 1. Wiedza: EK1 Student zna metody badawcze z ekologii molekularnej i ich zastosowanie w ekologii i ochronie przyrody, opisuje i identyfikuje rodzaje technik molekularnych i markerów; definiuje pojęcia z zakresu podstaw genetyki i ekologii molekularnej EK2 Student rozpoznaje podstawowe terminy w języku obcym (j. angielski) w zakresie metod molekularnych zastosowanych w ekologii i ochronie przyrody 2. Umiejętności: EK3 Student potrafi wykonać proste zadania w dziedzinie badań molekularnych i bezpiecznie posługuje się urządzeniami w laboratorium EK 4 Student posługuje się specjalistyczną terminologią w zakresie ekologii molekularnej i ochrony przyrody 3. Kompetencje: EK5 Student rozszerza i doskonali swoje umiejętności zawodowe w zakresie metod badawczych w laboratorium EK6 Student dba o rzetelność i wiarygodność swojej pracy w laboratorium |
Metody i kryteria oceniania: |
Ćwiczenia: średnia ocena z 3 wejściówek dotyczących ćwiczeń (5 pytań jednokrotnego wyboru/otwartych). 3 prawidłowe odpowiedzi - 3 4 prawidłowe odpowiedzi - 4 5 prawidłowych odpowiedzi - 5 Oceniane będzie z stosowania się do zasad BHP podczas zajęć. Dopuszczalna 1 nieobecność na zajęciach (usprawiedliwiona lub nieusprawiedliwiona). Wykład: Ocena z prezentacji artykułu związanego z tematem (sposób prezentacji, umiejętność wyszukania odpowiedniego materiału do prezentacji) – 50% oceny końcowej Ocena z testu końcowego – 50% oceny końcowej Test wiedzy - głównie pytania jednokrotnego wyboru, także pytania dotyczące prezentacji Suma punktów z testu powyżej 55 % zalicza przedmiot. od 55,1% - dst od 65,1% - dst+ od 70,1% - db od 80,1% - db+ od 85,1% - bdb Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest zaliczenie ćwiczeń, wygłoszenie i zaliczenie prezentacji artykułu oraz obecność na przynajmniej połowie wykładów. Obecność na wykładzie będzie sprawdzana. Dalsze szczegółowe kryteria oceniania zostaną podane uczestnikom w trakcie zajęć. |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2021/22" (zakończony)
Okres: | 2022-02-01 - 2022-06-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT WYK
CW
CW
|
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 15 godzin, 8 miejsc
Wykład, 30 godzin, 15 miejsc
|
|
Koordynatorzy: | Monika Bukacińska | |
Prowadzący grup: | Arkadiusz Buczyński, Monika Bukacińska | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: |
Przedmiot -
Egzaminacyjny
Ćwiczenia - Zaliczenie na ocenę Wykład - Egzaminacyjny |
|
E-Learning: | E-Learning (pełny kurs) z podziałem na grupy |
|
Skrócony opis: |
Przedmiot wprowadza podstawy wykorzystania metod molekularnych do zrozumienia ekologii i ewolucji dzikich gatunków oraz ich ochrony. Prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. |
|
Pełny opis: |
Wykład: 1. Wprowadzenie. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej. 2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA 3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody 4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów) 7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji) 10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia). 15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy) Ćwiczenia 1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni 2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru) 4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera 6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy 7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja |
|
Literatura: |
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa 2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa 3. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa 4. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 5. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 6. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa Literatura uzupełniająca: T. Beebee, G. Rowe 2004. An Introduction to Molecular Ecology. Oxford University Press Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu Artykuły przeglądowe w języku polskim (np. Kosmos, Wiadomości Ekologiczne) |
|
Wymagania wstępne: |
znajomość podstaw zoologii, ekologii, biochemii i genetyki oraz bierna znajomość języka angielskiego |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2022/23" (zakończony)
Okres: | 2023-02-01 - 2023-06-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT WYK
CW
CW
|
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 15 godzin, 8 miejsc
Wykład, 30 godzin, 15 miejsc
|
|
Koordynatorzy: | Monika Bukacińska | |
Prowadzący grup: | Arkadiusz Buczyński, Monika Bukacińska | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: |
Przedmiot -
Egzaminacyjny
Ćwiczenia - Zaliczenie na ocenę Wykład - Egzaminacyjny |
|
E-Learning: | E-Learning (pełny kurs) z podziałem na grupy |
|
Opis nakładu pracy studenta w ECTS: | Aktywność studenta - liczba godzin/nakład pracy studenta Udział w wykładzie - 30 Udział w ćwiczeniach - 15 Przygotowanie do egzaminu - 30 Przygotowanie prezentacji - 15 Suma godzin 90 [90/30= 3] Liczba ECTS 3 |
|
Skrócony opis: |
Przedmiot wprowadza podstawy wykorzystania metod molekularnych do zrozumienia ekologii i ewolucji dzikich gatunków oraz ich ochrony. Prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. |
|
Pełny opis: |
Wykład: 1. Wprowadzenie. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej. 2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA 3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody 4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów) 7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji) 10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia). 15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy) Ćwiczenia 1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni 2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru) 4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera 6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy 7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja |
|
Literatura: |
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa 2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa 3. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa 4. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 5. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 6. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa Literatura uzupełniająca: T. Beebee, G. Rowe 2004. An Introduction to Molecular Ecology. Oxford University Press Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu Artykuły przeglądowe w języku polskim (np. Kosmos, Wiadomości Ekologiczne) |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2023/24" (zakończony)
Okres: | 2024-02-15 - 2024-06-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT WYK
CW
CW
|
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 15 godzin, 8 miejsc
Wykład, 30 godzin, 15 miejsc
|
|
Koordynatorzy: | Monika Bukacińska | |
Prowadzący grup: | Arkadiusz Buczyński, Monika Bukacińska | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: |
Przedmiot -
Egzaminacyjny
Ćwiczenia - Zaliczenie na ocenę Wykład - Egzaminacyjny |
|
E-Learning: | E-Learning (pełny kurs) z podziałem na grupy |
|
Opis nakładu pracy studenta w ECTS: | Aktywność studenta - liczba godzin/nakład pracy studenta Udział w wykładzie - 30 Udział w ćwiczeniach - 15 Przygotowanie do egzaminu - 30 Przygotowanie prezentacji - 15 Suma godzin 90 [90/30= 3] Liczba ECTS 3 |
|
Skrócony opis: |
Przedmiot wprowadza podstawy wykorzystania metod molekularnych do zrozumienia ekologii i ewolucji dzikich gatunków oraz ich ochrony. Prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. |
|
Pełny opis: |
Wykład: 1. Wprowadzenie. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej. 2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA 3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody 4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów) 7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji) 10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia). 15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy) Ćwiczenia 1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni 2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru) 4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera 6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy 7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja |
|
Literatura: |
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa 2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa 3. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa 4. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 5. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 6. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa Literatura uzupełniająca: T. Beebee, G. Rowe 2004. An Introduction to Molecular Ecology. Oxford University Press Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu Artykuły przeglądowe w języku polskim (np. Kosmos, Wiadomości Ekologiczne) |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2024/25" (w trakcie)
Okres: | 2025-02-15 - 2025-06-30 |
Przejdź do planu
PN WT ŚR CZ PT WYK
CW
CW
|
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 15 godzin, 8 miejsc
Wykład, 30 godzin, 15 miejsc
|
|
Koordynatorzy: | Monika Bukacińska | |
Prowadzący grup: | Arkadiusz Buczyński, Monika Bukacińska | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: |
Przedmiot -
Egzaminacyjny
Ćwiczenia - Zaliczenie na ocenę Wykład - Egzaminacyjny |
|
E-Learning: | E-Learning (pełny kurs) z podziałem na grupy |
|
Opis nakładu pracy studenta w ECTS: | Aktywność studenta - liczba godzin/nakład pracy studenta Udział w wykładzie - 30 Udział w ćwiczeniach - 15 Przygotowanie do egzaminu - 30 Przygotowanie prezentacji - 15 Suma godzin 90 [90/30= 3] Liczba ECTS 3 |
|
Typ przedmiotu: | obowiązkowy |
|
Grupa przedmiotów ogólnouczenianych: | nie dotyczy |
|
Skrócony opis: |
Przedmiot wprowadza podstawy wykorzystania metod molekularnych do zrozumienia ekologii i ewolucji dzikich gatunków oraz ich ochrony. |
|
Pełny opis: |
Przedmiot prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. Wykład: 1. Wprowadzenie. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej. 2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA 3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody 4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów) 7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji) 10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia). 15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy) Ćwiczenia 1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni 2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru) 4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera 6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy 7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja |
|
Literatura: |
Wybrane rozdziały z: 1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa 2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa Literatura uzupełniająca: 1. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa 2. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 3. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa 4. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Kardynała Stefana Wyszyńskiego w Warszawie.